TA的每日心情 | 怒 2019-11-20 15:22 |
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签到天数: 2 天 [LV.1]初来乍到
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4 V1 W, Q- B7 u7 k+ {matlab降维工具包----drtoolbox
9 @5 n1 X# u2 t4 I! Y% z2 h! T" ~–很好安装,也很好用
8 E) N, n% V( x/ x" r F
. J; a; F* t7 J6 r& @) ]7 l安装4 X! @7 j* O8 r5 ]* u
1 m, Q( [8 p0 w+ ^. K- Z7 n
- 下载后解压在一个文件夹里。
- 打开matlab,添加文件。
1 d0 z( D7 [* G& R# z
. h* }* S: r$ p, [8 y8 h
' \. Y+ {- H- A* ~3 n' g/ u# r4 L* Z5 ?& b$ ~& @: o1 s
. j3 L$ g" Z0 U' e- d! ~
运行“rehash toolboxcach”.显示“compilation completed”即完成加载。: {( F- Q: \, h4 {6 ]0 z
测试:& Y: o. p) R3 P8 k; i0 m
X = data;%数据每个样本为一行。
+ G; y# S4 U1 o- R* r9 q8 W2 |4 Elabels = label;5 c- V5 g; x# N' H5 b: q3 w% p
no_dims = round(intrinsic_dim(X, 'MLE'));, j& J! m' {. x) e- P6 g5 N% g
disp(['MLE estimate of intrinsic dimensionality: ' num2str(no_dims)]);
- R1 W( x: e ^* C; E 0 J# W1 R x8 P; t% z
% PCA降维 Y* J* g4 U. \+ J( v
[mappedX, mapping] = compute_mapping(X, 'PCAA', no_dims);
6 o% f$ O l* lfigure, scatter(mappedX(:,1), mappedX(:,2), 5, labels);1 f# x5 m2 E, l
title('Result of PCA');
4 F) D- V& D) F6 @" [%KPCA降维
5 I' I7 A y/ g5 A& t: \" L+ a[mappedX, mapping] = compute_mapping(X, 'KPCA', no_dims);1 O# [5 O6 \1 I0 T, L# w5 l9 f
figure, scatter(mappedX(:,1), mappedX(:,2), 5, labels);
* a; E' s7 ^0 f$ f5 ~title('Result of KPCA');
6 k; u% t0 v! E& `; m3 ?%LDA降维
2 j a; x1 V* i. H- B[mappedX, mapping] = compute_mapping(X, 'LDA', no_dims);4 e. V, h7 m$ H) m, g$ C
figure, scatter(mappedX(:,1), mappedX(:,2), 5, labels);
# ^% ^- q- X+ ~+ b+ R4 s; ctitle('Result of LDA');# J( V6 t0 s5 Z1 R( R# O
3 h- a" q0 f: t. r; J7 B" W0 V0 t( P! [& c
结果:
9 o; p/ L8 u9 B; Y
# G+ r0 z5 m2 x Q
; F- W9 W+ g* X; S# F
# Y/ e' J. o: n0 w; ~
8 w+ T& q& B5 i9 q
- _$ N8 p- c/ O, A
补充:; U; Z* F/ C) s* @3 m- {' J- q
数据不知道怎么搞上去。就放个地址吧。链接:https: //pan.baidu.com/s/11CzO2_DWHds_PSTDtR69Sw
. `% x& q0 k& n提取码:9tfd% {4 ?7 Y: s. Q' }" m( {
问题:在使用时,发现该工具箱中的pca函数与matlab自带函数冲突,便将该工具箱中的pca函数名字给改掉。如下:
8 h9 O1 @1 x: `, X" p- F1 ?1 m/ G/ F2 P2 c
0 r( w+ \+ o$ l* E) n) q4 P3 f* U( M8 j1 U6 S
+ V+ f6 w2 y( L2 p
: N6 C% S/ N; d/ F) ]2 D
F5 F4 [8 j' S$ Y* l2 t/ A8 n
7 n8 r- K$ ~! n1 \. `! N: B这样以后用matlab本身的pca即
: N/ }- C, Z) c, e" ]& T6 F! l$ Q8 G# v9 R+ `/ Z& C' G. _9 e
[coef,score,latent] =pca(data);
+ _( u2 i: V5 |1 k3 ?1 ~/ I' V) _+ R9 {! k9 z) D$ C S4 A
$ r! y9 Z% j" ~; X" P
调用该工具包中的pca利用% z# m* K7 ^/ x; \( L' n4 G9 T
1 z) l4 Q/ j9 Y$ u2 Y0 U$ d
[mappedX, mapping] = compute_mapping(X, 'PCAA', no_dims);
. U6 x3 A3 e" P8 ]figure, scatter(mappedX(:,1), mappedX(:,2), 5, labels);
F' {. u; j2 N2 W' Q4 Ftitle('Result of PCA');`
6 s u/ ~: ^0 i( F" \" b
" _+ Y( u" B9 J; k0 u; y: Y% }- O
+ `0 L$ \2 W# M- n7 G/ V; A
2 U4 |1 s1 X4 O4 O D" P5 W+ _- r0 X: M6 G1 }# l, }& }
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