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linux上用PBS脚本运行matlab

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发表于 2020-2-26 17:16 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式

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x
我的目的:  希望在linux上用PBS脚本提交并运行matlab程序,需要运行的matlab程序文件名为CStest.m
/ w8 i: ~9 t2 ^% u5 S已进行的操作  ?% _; J" z0 Z0 f4 j3 n0 f5 A
   1. 用了 Xshell 连接 linux 服务器;
; p- [- a0 S' x/ q   2. 在Xshell中直接运行了我的m文件CStest.m是可以出结果的,输入的命令行指令为:
0 H4 ?) t$ K7 v; ^& m! i    /public/software/apps/MATLAB/R2019/bin/matlab-nodisplay -r CStest, E2 N8 r, a( r0 }" M, d1 G
    反馈结果如附图: T( b- x: {) q
   3. 在命令行用 vim CT2.pbs 指令编辑了pbs脚本并保存;
' z2 s  [( B9 r0 ~   4. 提交:qsub CT2.pbs;(提交后会报错)
1 T- f# V* C7 |! c% f" D6 @4 B# t% M* e! m9 d# T! k3 J
报错
2 B) q, P- P+ M出来一大堆信息,不是很看得懂,明显感觉有问题的报错是:
+ O% L0 _& G5 M& A: i+ @$ f. t# @Can't exec "/cliparastor/tools/nWatch": No such file or directory at /cliparastor/sysctl/parastor_ctl_pm/pub_oper.pm line 367.
. |6 I& O% v# |' I# r* `( Z5 c4 ~. |% x
PBS脚本内容
. D2 W& u; k8 h    #!/bin/bash& v3 O1 v* d6 ]: o3 A
    #PBS -N a1
' n8 ~, F# F0 Z) o% w$ [4 \    #PBS -I nodes=1:ppn=4  G6 ~. y) C" r3 Z4 J
    #PBS -j oe
0 @- |5 c- M. @    #PBS -q low
+ p( R, H' i) J6 |1 H    #PBS -I walltime=10:00:003 g9 o' Q# G; x7 W. w# L8 _2 ?0 m  t
    cd $PBS_O_WORKDIR
9 ^' Z/ I$ F% ~  N1 q    /public/software/apps/MATLAB/R2019/bin/matlab <CStest.m
( u/ ]( ?, u, G* P+ Z" [0 }, d& |0 H% p. J' p
疑问:, ]  `1 m8 [4 z" b: W1 L
   1. PBS脚本是否写的正确?
2 n) g. e' ^! D1 }   2. 报的错误应该如何解决?
# b7 y/ p$ ]5 b7 }# @    ) ~' j' u- s/ X! {
请问有没有弄过的大神,可以帮忙看看~感谢感谢!!
0 ^4 y7 F& R5 {: ~' q0 o% y% ]; @

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2#
发表于 2020-2-26 17:56 | 只看该作者
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