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linux上用PBS脚本运行matlab

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发表于 2020-2-26 17:16 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式

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我的目的:  希望在linux上用PBS脚本提交并运行matlab程序,需要运行的matlab程序文件名为CStest.m
6 A+ S  E3 n, e3 }. m% }3 n已进行的操作: v( t3 d$ c% t
   1. 用了 Xshell 连接 linux 服务器;( I* S2 G, [  s0 _! C6 e& N
   2. 在Xshell中直接运行了我的m文件CStest.m是可以出结果的,输入的命令行指令为:) _3 x; |0 X$ d; Y
    /public/software/apps/MATLAB/R2019/bin/matlab-nodisplay -r CStest$ Z( t. Y7 r4 I- f3 L* g
    反馈结果如附图
7 j3 T1 `( D; t" ^& k$ P& i   3. 在命令行用 vim CT2.pbs 指令编辑了pbs脚本并保存;$ I/ _- c" F! N! o! a; \
   4. 提交:qsub CT2.pbs;(提交后会报错)
; m  q/ D- L- ~3 l, F2 |  S$ E- b( y2 s% g' c. u
报错; p  G. |" `9 d& g+ d
出来一大堆信息,不是很看得懂,明显感觉有问题的报错是:4 d! ~6 F. @, p
Can't exec "/cliparastor/tools/nWatch": No such file or directory at /cliparastor/sysctl/parastor_ctl_pm/pub_oper.pm line 367.  P/ A& Z. Q4 h) o- I
1 p/ {) W1 h2 t
PBS脚本内容  \$ }. Y/ i2 H* X
    #!/bin/bash% j1 O5 \( G; }& G6 m8 W$ o: d
    #PBS -N a14 Z) s7 r3 V' z1 u" q; k
    #PBS -I nodes=1:ppn=4( s8 Z* L+ S/ j- h( F9 E) \
    #PBS -j oe
# {- w- |" H; X* y0 J1 B' d' P5 O9 Y    #PBS -q low
, g# |: H* ^) {3 p    #PBS -I walltime=10:00:00
0 x* g5 |7 w: h5 ~- l  J    cd $PBS_O_WORKDIR- `4 r# z% F) ^- ^. n' y% J. W
    /public/software/apps/MATLAB/R2019/bin/matlab <CStest.m* S* `# X+ l% |5 f
8 |; a8 @6 x  P7 ]
疑问:/ C  P, I- |' C
   1. PBS脚本是否写的正确?
0 G2 j, w3 g6 ?$ `1 J, e: J   2. 报的错误应该如何解决?! n+ y# u* i+ }7 K) Q
   
6 m/ h; F2 Y7 m/ N0 o1 r6 [. B请问有没有弄过的大神,可以帮忙看看~感谢感谢!!
! Z2 R) R* b/ i0 d0 e2 r' n1 K/ O( V

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发表于 2020-2-26 17:56 | 只看该作者
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